在行星布拉姆附近突然出现了一个神秘的人造天体，它吸收了所有的宇宙机器人并制造出了最强的超级机器人军团。为了阻止它，赛罗奥特曼与镜子骑士、红莲火焰和詹伯特联手对敌。

故事发生在与伯利亚银河帝国的战斗结束一年后，塞罗奥特曼在本作中与红莲火焰、镜子骑士、詹伯特阻止天体的运转，并结识了新的伙伴詹奈，他们一起踏上了新的战斗旅程。

最强兵士贝利奥斯因为渴想野生太阳火把的实力而坠进阴郁，但他的兵变最终被奥特之王平定，并被打进宇宙牢狱……多年今后，被扎布拉星人救出的贝利奥斯重回光之国，打败了众奥特兵士，成功夺走野生太阳火把并到怪兽墓场往。掉了火把的奥…

最强兵士贝利奥斯因为渴想野生太阳火把的实力而坠进阴郁，但他的兵变最终被奥特之王平定，并被打进宇宙牢狱。多年今后，被扎布拉星人救出的贝利奥斯重回光之国，打败了众奥特兵士，成功夺走野生太阳火把并到怪兽墓场往。掉了火把的奥特…

从行星波利斯逃脱等待重返地球的空间盘龙号，自称“雷奥尼克斯猎人”的神秘男子侵入其中。同时，其他的宇宙人们也正暗中开始行动，ZAP SPACY的船员们被卷入战争。

曾被光之国封印在宇宙监狱中的邪恶战士——“贝利亚奥特曼”，利用扎拉布星人成功越狱，并发誓要复仇！他夺取了奥特曼战士的生命之源：人工太阳的核心、以及禁止使用的神器“千兆战斗仪”，企图复活并控制怪兽墓地里的100头怪兽和宇宙人…

ZAP SPACY收到了求救旌旗暗号，雷等人敏捷驾驶盘龙号前往，但却被吸进扭曲空间。在扭曲空间的一颗惑星上，雷他们碰见了其他次元的本人，并且出现了一头机械哥莫拉。原来在这个星球上，莎乐美星人正在举行奥秘实验，令所有次元的接洽都集…

塞罗奥特曼在本作中与红莲火焰、镜子骑士、詹伯特阻止天体的运转，并结识了詹奈。